С «Миланом» он выиграл два чемпионата Италии с разницей почти в 10 лет, Кубок Италии, два Суперкубка и две Лиги чемпионов. Чемпион мира, член Зала славы «Милана» и лучший итальянский голеадор в главном турнире Европы — его трофеи впечатляют.
Самый яркий момент в карьере Индзаги с «Миланом» случился в мае 2007 года. Тогда он оформил дубль в финале Лиги чемпионов против «Ливерпуля», принеся клубу седьмой титул. Эта игра укрепила его статус великого игрока.
В интервью Men’s Health, опубликованном MilanPress, Индзаги вспомнил тот матч и своих партнеров:
«Иногда я пересматриваю тот дубль в Афинах. Десять ночей подряд я просыпался с мыслью, что мне еще предстоит та игра. Мне повезло играть с великими — Пирло, Гаттузо, Амброзини, Седорф. Если выбирать одного, то это Кака — он был особенным. Мы добились невероятного с ним. Шевченко тоже был потрясающим, а с Ибрагимовичем у нас сложился отличный дуэт. Неста и Мальдини? Рад, что они стали моими одноклубниками».